华大基因研究院联合中国水产科学研究院首次完成花鲈全基因组测序

时间 :2023-01-17 作者 : 来源: 浏览 :10843 分类 :行业资讯
中国水产科学研究院黄海水产研究所和华大基因研究院联合团队利用NGS和Hi-C技术首次完成花鲈全基因组测序和精细图谱绘制。其基因组大小为668Mb,重复序列为132Mb,注释基因为22015个。

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中国水产科学研究院黄海水产研究所和华大基因研究院联合团队利用NGS和Hi-C技术首次完成花鲈全基因组测序和精细图谱绘制。

其基因组大小为668Mb,重复序列为132Mb,注释基因为22015个。进化分析表明,花鲈与欧洲鲈鱼关系最近,大概在8700万年前开始分化,并且二者染色体间呈现较好的共线性。

花鲈有着珍贵的使用价值和药用价值。古代诗人曾以“江上往来人,但爱鲈鱼美”的诗句称赞其体态和味道。在沿海一带,产量较高,为产区的重要食用鱼之一。其肉每百克含蛋白质17.5克,脂肪3.1克,碳水化合物0.4克,热量100千卡,钙56毫克,磷131毫克,铁1.2毫克,维生素B20.23毫克,烟酸1.7毫克和微量维生素B1。其鳃性味甘、平,有止咳化痰之功效,可用以治疗小儿百日咳。其肉性味甘、温,有健脾益气之功效,常用于治疗慢性胃痛、脾虚泄泻、小儿疳积、消化不良、消瘦等症;若手术后食用亦能促进伤口生肌愈合。

华大基因研究团队和国家水产研究所通过比较基因组学分析,筛选到125个花鲈特异基因家族,可能与花鲈自身的特征密切相关。该研究可帮助深入理解花鲈的生命过程和进化特征,也为今后解析花鲈重要经济性状,比如生长、抗病抗逆、性别、免疫等性状的形成机制,创建基因组育种技术奠定了重要基础。

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